V súvislosti so stúpajúcim znečistením prírodných vôd i s rastúcimi poznatkami o hygiene sa voda spravidla čím ďalej viac upravovala použitím chemikálií. Dnes považujú návštevníci bazénov a kúpalísk túto chemicky upravenú vodu často za problematickú, hlavne v súvislosti s alergickými ochoreniami, podráždením kože, začervenaním očí a pod.
V biobazénoch a kúpacích jazerách je voda upravovaná biologicky s využitím samočistenia prírodných vôd. Pri ňom prebiehajú biologické, fyzikálne a chemicko-fyzikálne procesy. Cieľom nie je vytvorenie „sterilnej" bazénovej vody, ale skôr vybudovanie ekosystému, v ktorom je v špeciálnej regeneračnej zóne (určená pre úpravu vody) eliminované znečistenie a zaťaž, ktoré spôsobili kúpajúce sa osoby.
Hlavnou úlohou je starostlivosť o zdravie a bezpečnosť užívateľov. Biobazény a ekologické prírodné kúpacie plochy majú dnes stále väčší význam práve pre obce a mestá. Ponúkajú totiž možnosť, ako s nízkymi nákladmi opäť sprevádzkovať nefunkčné kúpaliská, ktoré vyžadujú sanáciu, a ktorým v dôsledku finančnej situácie hrozí uzavretie a tak zaistiť ich ďalšiu existenciu a možnosť ich prevádzkovania.
Verejný biobazén je navrhovaný buď ako jednokomorový - regeneračná časť je situovaná po obvode nádrže - alebo ako dvojkomorový, kde je regeneračná časť oddelená od vlastnej nádrže na kúpanie a prepojenie je riešené gravitačne alebo prečerpávaním. V prípade dvojkomorového systému je akákoľvek vegetácia umiestnená v regeneračnej časti. Dvojkomorový systém je pre verejné kúpacie jazerá jednoznačne najvýhodnejší. Podľa zvoleného systému sú navrhnuté cirkulačné okruhy. Kapacita biokúpaliska sa stanoví prostým výpočtom tak, aby na jedného kúpajúceho pripadalo 8 až 10m2 vodnej plochy nádrže. Stanovenie filtračnej kapacity biologickej časti je ďaleko zložitejšie. Vychádza z energetickej bilancie prístupných živín a schopnosti biologických zón tieto živiny viazať a umožniť následne ich vyťaženie.